門診污水先經格柵隔除大顆粒的漂浮物幾雜物，同時與化糞池的出水混合進入調節池，在調節池內，不同時間排出的污水能均勻地混合，使后續處理工藝的處理負荷相對穩定，同時可以平衡高峰期的出流量，使系統不至于因為瞬間水量過大而影響處理效果。

    在調節池出口出設置一級提升泵，采用自吸形式，以減少投資，然后污水進入平流式沉淀池布水廊道，通過布水墻進入平流式沉淀池，在沉淀池中，大部分的懸浮物被沉淀下來，沉積在池內的泥垢中，有設在操作間內的污泥泵泵至化糞池內進行厭氧消化。

    沉淀池的出水進入集水池，集水池內設兩臺二級自吸式污水提升泵（兩臺，一用一備），污水泵有集水池內的液位控制器根據池內的液位來控制，保證污水處理系統連續運行。污水經沉淀、水量、水質調節后，由泵泵至設備間，交由臭氧消毒被zui大限度地除區，同時，污水中的相當部分有機物質如COD_cr及BOD₅也同時被氧化除去。處理后的污水由設備間內的污水泵（兩臺，一用一備）泵至清水池，zui后自流進入市政排水管道。

    臭氧氧化塔的尾氣尚含有多余臭氧，通過管道引至調節池底，通過在池內安裝的穿孔管擴散，對污水作前處理，同時將多余的臭氧吸收，以除去臭味，保證工作人員健康。

    隔柵內沉淀物定期運送至衛生防疫部門處理。